Presso il Dipartimento sono attivi i seguenti Corsi di Dottorato:

1. Scienze linguistiche (sede amministrativa: Università di Pavia) 
   Scienze linguistiche (da a.a. 2020-2021 sede amministrativa: Università degli studi di Bergamo)
2. Studi umanistici transculturali
3. Studi filologici e linguistici sul patrimonio scritto e orale (da a.a. 2023-2024)
4. Landscape Studies for Global and Local Challenges (da a.a 2024-2025)